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  • Microbiome: 再论扩增子功能预测分析(Picrust)的效果

    Microbiome: 再论扩增子功能预测分析(Picrust)的效果

    Picrust作为扩增子测序功能预测的工具已经被广泛使用了。但是它会与真实情况存在较大的偏差,详见前文对Picrust局限性的介绍:PICRUSt不灵啦?别慌,它一直都不咋灵~此文中我推断预测的准确性和测序深度有很强的关系。Picrust2...

    功能预测 PICRUSt
  • 16S在线功能预测分析 | 分析技能

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    PICRUSt(phylogeneticinvestigation of communities by reconstruction of unobserved states)通过隐性状态重建进行群落系统进化的研究,该软件基于16S rDN...

    16S PICRUSt 功能预测
  • PICRUSt 2——更加强大的菌群功能预测工具

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    一篇高质量的16s文章除了实验设计合理外,也需要在数据挖掘上下足功夫。在16s微生物群落数据分析中,我们一般遵循着从整体到精细、从群落结构差异到功能差异的分析思路。一、功能分析的价值在完成前期样本整体层面的物种组成、α多样性、β多样性等分析...

    PICRUSt