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密码子图书馆

  • KEGG pathway介绍及其使用方法

    KEGG pathway介绍及其使用方法

    KEGG,全称“京都基因与基因组百科全书”,英文全称Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes。1995年,为了使用计算机预测出比较复杂的细胞中的通路或者生物的复杂行为,日本京都大学生物信息学中心的Kan...

    KEGG Pathway
  • 宏基因组功能注释(以COG为例)

    宏基因组功能注释(以COG为例)

    Contigs/Scaffolds序列经基因预测、ORF开放阅读框识别(Open Reading fr ame)和蛋白翻译之后,就可以进行功能注释分析了。我们将基因/蛋白序列在特定的数据库中搜索比对,从而完成功能注释分析。常用的功能数据库主...

    KEGG
  • 如何看懂KEGG通路图?

    如何看懂KEGG通路图?

    KEGG PATHWAY数据库是进行基因功能分析和代谢网络研究的强有力工具,不管你是做转录组还是蛋白组,你都有必要学会如何看得懂KEGG通路图。下面就以PI3K-AKT signal pathway为例,看下如何看懂KEGG通路图吧!keg...

    KEGG
  • KEGG数据库的使用方法与介绍

    KEGG数据库的使用方法与介绍

    KEGG的数据KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;另外 KEGG中有一个“...

    KEGG
  • KEGG数据库简介(收藏

    KEGG数据库简介(收藏

    无论转录组测序、蛋白质组测序,或者是相关测序分析,在做基因或蛋白功能注释时,常用的数据库主要有GO、KEGG、Nr、Pfam、COG、Swissprot等。在这些数据库中,KEGG和GO数据库是最常用的两个数据库,今天小编就给大家简单介绍K...

    KEGG
  • 一文读懂KEGG数据库

    一文读懂KEGG数据库

    KEGG数据库介绍在进行生物学实验或者生物信息的学习中,都会听说KEGG富集分析,而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环。这种分析方法依托的是由 Kanehisa实验室 在1995年开发的KEGG数据库,全称为 Kyo...

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